Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL1

TMEM74, Transmembrane protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM74Q96NL1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM74Q96NL1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM74Q96NL1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM74Q96NL1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms