Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGD4Q96M96 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGD4Q96M96 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGD4Q96M96 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms