Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SAMD8Q96LT4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SAMD8Q96LT4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms