Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
EAF1Q96JC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EAF1Q96JC9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms