Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
COG3Q96JB2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
COG3Q96JB2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
COG3Q96JB2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
COG3Q96JB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
COG3Q96JB2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 183.7 ms