Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRELD1Q96HD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRELD1Q96HD1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRELD1Q96HD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms