Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBGCP3Q96CW5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBGCP3Q96CW5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms