Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF30

WHAMM, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMQ8TF30 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WHAMMQ8TF30 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WHAMMQ8TF30 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WHAMMQ8TF30 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms