Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY8

TMEM52, Transmembrane protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM52Q8NDY8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM52Q8NDY8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM52Q8NDY8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms