Protein–RNA interactions for Protein: Q86U70

LDB1, LIM domain-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1Q86U70 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LDB1Q86U70 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LDB1Q86U70 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LDB1Q86U70 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms