Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KRT28Q7Z3Y7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KRT28Q7Z3Y7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KRT28Q7Z3Y7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KRT28Q7Z3Y7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms