Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CHST9Q7L1S5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHST9Q7L1S5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHST9Q7L1S5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHST9Q7L1S5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms