Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
USP30Q70CQ3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP30Q70CQ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
USP30Q70CQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms