Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC23A3Q6PIS1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC23A3Q6PIS1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC23A3Q6PIS1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms