Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
C12orf60Q5U649 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
C12orf60Q5U649 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C12orf60Q5U649 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms