Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4J0

GCNT6, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 6, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT6Q5T4J0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GCNT6Q5T4J0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GCNT6Q5T4J0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCNT6Q5T4J0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms