Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CFAP70Q5T0N1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CFAP70Q5T0N1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CFAP70Q5T0N1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFAP70Q5T0N1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CFAP70Q5T0N1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms