Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CC2D1BQ5T0F9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CC2D1BQ5T0F9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CC2D1BQ5T0F9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CC2D1BQ5T0F9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms