Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SOHLH1Q5JUK2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SOHLH1Q5JUK2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SOHLH1Q5JUK2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms