Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRC9

FAM47A, Protein FAM47A, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47AQ5JRC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM47AQ5JRC9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM47AQ5JRC9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FAM47AQ5JRC9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FAM47AQ5JRC9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms