Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E8

ZC3H12A, Endoribonuclease ZC3H12A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12AQ5D1E8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZC3H12AQ5D1E8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZC3H12AQ5D1E8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZC3H12AQ5D1E8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms