Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
EEA1Q15075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC39.01■■■■□ 3.84
EEA1Q15075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC39■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.97■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.97■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
EEA1Q15075 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.92■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.9■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.89■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.89■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC38.88■■■■□ 3.82
EEA1Q15075 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.88■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
EEA1Q15075 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
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