Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ERCC8Q13216 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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ERCC8Q13216 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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ERCC8Q13216 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERCC8Q13216 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERCC8Q13216 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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