Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CHRNEQ04844 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHRNEQ04844 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHRNEQ04844 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CHRNEQ04844 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms