Protein–RNA interactions for Protein: Q02447

SP3, Transcription factor Sp3, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP3Q02447 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SP3Q02447 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP3Q02447 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP3Q02447 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP3Q02447 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SP3Q02447 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP3Q02447 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP3Q02447 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SP3Q02447 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SP3Q02447 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP3Q02447 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP3Q02447 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP3Q02447 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP3Q02447 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP3Q02447 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SP3Q02447 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP3Q02447 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SP3Q02447 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SP3Q02447 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SP3Q02447 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SP3Q02447 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP3Q02447 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP3Q02447 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SP3Q02447 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP3Q02447 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SP3Q02447 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SP3Q02447 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP3Q02447 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP3Q02447 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP3Q02447 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SP3Q02447 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SP3Q02447 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP3Q02447 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SP3Q02447 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP3Q02447 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP3Q02447 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SP3Q02447 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SP3Q02447 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SP3Q02447 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SP3Q02447 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SP3Q02447 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SP3Q02447 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms