Protein–RNA interactions for Protein: Q00723

PRP38, Pre-mRNA-splicing factor 38, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP38Q00723 MRK1YDL079C 1506 nt5.5□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SRP101YDR292C 1866 nt5.5□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SOH1YGL127C 384 nt5.5□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 MRP51YPL118W 1035 nt5.5□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 ATG12YBR217W 561 nt5.5□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 MTF2YDL044C 1323 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SNU71YGR013W 1863 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 TNA1YGR260W 1605 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SYF2YGR129W 648 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 PSH1YOL054W 1221 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 RRT2YBR246W 1164 nt5.49□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 IME2YJL106W 1938 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 EPS1YIL005W 2106 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 PUF3YLL013C 2640 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 TRP3YKL211C 1455 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 PRP46YPL151C 1356 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 YEA6YEL006W 1008 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 YPL102CYPL102C 303 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 ACC1YNR016C 6702 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 MCM6YGL201C 3054 nt5.48□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 RET1YOR207C 3450 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SFB3YHR098C 2790 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 LSG1YGL099W 1923 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 CBP4YGR174C 513 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 SNO4YMR322C 714 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 RHO2YNL090W 579 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 YNL165WYNL165W 1221 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 RPS15YOL040C 429 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 HSP33YOR391C 714 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 HSP32YPL280W 714 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 STE13YOR219C 2796 nt5.47□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 GEX2YKR106W 1848 nt5.46□□□□□ -1.53
PRP38Q00723 STL1YDR536W 1710 nt5.46□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YGL072CYGL072C 360 nt5.46□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 BZZ1YHR114W 1902 nt5.46□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 OPT1YJL212C 2400 nt5.46□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YDL144CYDL144C 1071 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 CSM2YIL132C 642 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 GEP5YLR091W 882 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 HCR1YLR192C 798 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 VPS70YJR126C 2436 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 ERG7YHR072W 2196 nt5.45□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 BUL1YMR275C 2931 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 DDC1YPL194W 1839 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YCL065WYCL065W 369 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YJL171CYJL171C 1191 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 MTC2YKL098W 1074 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 POR1YNL055C 852 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 CSL4YNL232W 879 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 EIS1YMR031C 2532 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 BUD9YGR041W 1644 nt5.44□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 AAP1YHR047C 2571 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 ASH1YKL185W 1767 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YDL023CYDL023C 321 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 MDH3YDL078C 1032 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YRA1YDR381W 681 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YIL060WYIL060W 435 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YPR098CYPR098C 486 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 BAP2YBR068C 1830 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 VMS1YDR049W 1899 nt5.43□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 ORC5YNL261W 1440 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 HEM3YDL205C 984 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YKL223WYKL223W 333 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 HOR7YMR251W-A 180 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 RSC30YHR056C 2652 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 GSY2YLR258W 2118 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 CDC19YAL038W 1503 nt5.42□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 YDL119CYDL119C 924 nt5.41□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 CLP1YOR250C 1338 nt5.41□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 RIM101YHL027W 1878 nt5.41□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 SEC12YNR026C 1416 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 ALT1YLR089C 1779 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 MKK2YPL140C 1521 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 DON1YDR273W 1098 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 PAN6YIL145C 930 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 PGA2YNL149C 390 nt5.4□□□□□ -1.54
PRP38Q00723 TEF1YPR080W 1377 nt5.4□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 TEF2YBR118W 1377 nt5.4□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 TFC6YDR362C 2019 nt5.4□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 PDH1YPR002W 1551 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 VCX1YDL128W 1236 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 REC114YMR133W 1287 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 FLC3YGL139W 2409 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 VTH1YIL173W 4650 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 VTH2YJL222W 4650 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 UTP18YJL069C 1785 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 TRK2YKR050W 2670 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 TAH18YPR048W 1872 nt5.39□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt5.38□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 YGR139WYGR139W 339 nt5.38□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 MRPL22YNL177C 930 nt5.38□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 RNR3YIL066C 2610 nt5.38□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 SHM1YBR263W 1473 nt5.38□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 HSP150YJL159W 1242 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 RPO26YPR187W 468 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 SCT1YBL011W 2280 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 BRL1YHR036W 1416 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 PIF1YML061C 2580 nt5.37□□□□□ -1.55
PRP38Q00723 HPF1YOL155C 2904 nt5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms