Protein–RNA interactions for Protein: P52657

GTF2A2, Transcription initiation factor IIA subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A2P52657 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2A2P52657 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GTF2A2P52657 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GTF2A2P52657 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
GTF2A2P52657 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2A2P52657 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A2P52657 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A2P52657 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A2P52657 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A2P52657 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2A2P52657 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2A2P52657 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GTF2A2P52657 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GTF2A2P52657 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GTF2A2P52657 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GTF2A2P52657 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GTF2A2P52657 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GTF2A2P52657 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms