Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	PUP2	YGR253C	783 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	PRS4	YBL068W	981 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	COQ3	YOL096C	939 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	MBF1	YOR298C-A	456 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	UBA3	YPR066W	900 nt		5.4	□□□□□ -1.54
SIP1	P32578	GIP2	YER054C	1647 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	MET7	YOR241W	1647 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	HRQ1	YDR291W	3234 nt		5.4	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YDR278C	YDR278C	318 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	SNM1	YDR478W	597 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ERV14	YGL054C	417 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YIL086C	YIL086C	309 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	COA1	YIL157C	594 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YAL019W-A	YAL019W-A	570 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	DID2	YKR035W-A	615 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	PRE5	YMR314W	705 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YOL050C	YOL050C	321 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	NHP6B	YBR089C-A	300 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	PEX3	YDR329C	1326 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	SLD2	YKL108W	1362 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ROG3	YFR022W	2202 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	VNX1	YNL321W	2727 nt		5.39	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	LAP2	YNL045W	2016 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	AGX1	YFL030W	1158 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	VAM7	YGL212W	951 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	FMP48	YGR052W	1110 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	RPR2	YIR015W	435 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YIR042C	YIR042C	711 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	SPC34	YKR037C	888 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YLR283W	YLR283W	945 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	COX10	YPL172C	1389 nt		5.38	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	EPS1	YIL005W	2106 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	CYS3	YAL012W	1185 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YKL223W	YKL223W	333 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	SWD1	YAR003W	1281 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	GSY2	YLR258W	2118 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	RPR1	RPR1	369 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	CST26	YBR042C	1194 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	CLB1	YGR108W	1416 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ORC5	YNL261W	1440 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ARO9	YHR137W	1542 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	NSI1	YDR026C	1713 nt		5.37	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	NPA3	YJR072C	1158 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YLR296W	YLR296W	327 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	PEX32	YBR168W	1242 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YLH47	YPR125W	1365 nt		5.36	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	FRE7	YOL152W	1863 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	CST6	YIL036W	1764 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	PGK1	YCR012W	1251 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YGL101W	YGL101W	648 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YGR176W	YGR176W	348 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YLF2	YHL014C	1218 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	QCR8	YJL166W	285 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ATP12	YJL180C	978 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YKL031W	YKL031W	414 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	PEX22	YAL055W	543 nt		5.35	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	VPS36	YLR417W	1701 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	RNR3	YIL066C	2610 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	MAD3	YJL013C	1548 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	CNE1	YAL058W	1509 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	FLC3	YGL139W	2409 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	QRI1	YDL103C	1434 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	NUP49	YGL172W	1419 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	MAF1	YDR005C	1188 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	COX20	YDR231C	618 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ERG26	YGL001C	1050 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YGL262W	YGL262W	528 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	RRP40	YOL142W	723 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YOR289W	YOR289W	756 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	YPL257W	YPL257W	582 nt		5.34	□□□□□ -1.55
SIP1	P32578	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.34	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	DXO1	YDR370C	1329 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MAC1	YMR021C	1254 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	MRPL10	YNL284C	969 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	NPT1	YOR209C	1290 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	CTF19	YPL018W	1110 nt		5.33	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	RIM101	YHL027W	1878 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	INO2	YDR123C	915 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	DUO1	YGL061C	744 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	ECM14	YHR132C	1293 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	SED5	YLR026C	1023 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YOX1	YML027W	1158 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YMR135W-A	YMR135W-A	534 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	IES2	YNL215W	963 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YOR020W-A	YOR020W-A	273 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YPL113C	YPL113C	1191 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	CTS2	YDR371W	1536 nt		5.32	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	VAN1	YML115C	1608 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	TEP1	YNL128W	1305 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YHL045W	YHL045W	348 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	NVJ1	YHR195W	966 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	RHO3	YIL118W	696 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YMR075C-A	YMR075C-A	366 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	SET4	YJL105W	1683 nt		5.31	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	PFA5	YDR459C	1125 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	YKL169C	YKL169C	384 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	POR1	YNL055C	852 nt		5.3	□□□□□ -1.56
SIP1	P32578	ARG8	YOL140W	1272 nt		5.3	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms