Protein–RNA interactions for Protein: P30203

CD6, T-cell differentiation antigen CD6, humanhuman

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD6P30203 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD6P30203 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD6P30203 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD6P30203 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD6P30203 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD6P30203 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD6P30203 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD6P30203 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD6P30203 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD6P30203 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD6P30203 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD6P30203 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD6P30203 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD6P30203 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD6P30203 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD6P30203 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD6P30203 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD6P30203 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD6P30203 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD6P30203 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD6P30203 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD6P30203 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD6P30203 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD6P30203 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD6P30203 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD6P30203 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD6P30203 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD6P30203 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms