Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD1CP29017 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CD1CP29017 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CD1CP29017 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CD1CP29017 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CD1CP29017 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CD1CP29017 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CD1CP29017 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CD1CP29017 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CD1CP29017 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD1CP29017 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD1CP29017 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD1CP29017 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CD1CP29017 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CD1CP29017 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CD1CP29017 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD1CP29017 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD1CP29017 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD1CP29017 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CD1CP29017 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CD1CP29017 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD1CP29017 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD1CP29017 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD1CP29017 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CD1CP29017 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CD1CP29017 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD1CP29017 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CD1CP29017 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD1CP29017 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD1CP29017 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD1CP29017 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD1CP29017 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms