Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LOXP28300 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LOXP28300 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXP28300 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXP28300 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXP28300 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXP28300 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LOXP28300 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LOXP28300 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LOXP28300 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LOXP28300 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LOXP28300 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LOXP28300 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXP28300 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXP28300 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXP28300 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXP28300 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LOXP28300 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LOXP28300 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
LOXP28300 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms