Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CA4P22748 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CA4P22748 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CA4P22748 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA4P22748 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CA4P22748 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA4P22748 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA4P22748 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA4P22748 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA4P22748 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CA4P22748 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CA4P22748 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CA4P22748 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CA4P22748 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CA4P22748 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CA4P22748 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CA4P22748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CA4P22748 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA4P22748 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CA4P22748 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CA4P22748 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA4P22748 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CA4P22748 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.5 ms