Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPL17P18621 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPL17P18621 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPL17P18621 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPL17P18621 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL17P18621 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL17P18621 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL17P18621 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPL17P18621 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPL17P18621 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPL17P18621 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPL17P18621 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RPL17P18621 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RPL17P18621 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL17P18621 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL17P18621 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL17P18621 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RPL17P18621 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RPL17P18621 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL17P18621 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms