Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDK1P06493 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDK1P06493 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDK1P06493 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK1P06493 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDK1P06493 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDK1P06493 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDK1P06493 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDK1P06493 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDK1P06493 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK1P06493 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK1P06493 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK1P06493 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDK1P06493 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms