Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB4AP04350 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBB4AP04350 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBB4AP04350 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms