Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD1O95696 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD1O95696 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BRD1O95696 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BRD1O95696 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
BRD1O95696 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD1O95696 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD1O95696 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BRD1O95696 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BRD1O95696 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD1O95696 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
BRD1O95696 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BRD1O95696 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BRD1O95696 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
BRD1O95696 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BRD1O95696 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRD1O95696 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRD1O95696 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BRD1O95696 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BRD1O95696 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD1O95696 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD1O95696 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD1O95696 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRD1O95696 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD1O95696 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD1O95696 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD1O95696 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD1O95696 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRD1O95696 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD1O95696 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRD1O95696 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD1O95696 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRD1O95696 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRD1O95696 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD1O95696 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRD1O95696 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms