Protein–RNA interactions for Protein: O75386

TULP3, Tubby-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP3O75386 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TULP3O75386 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TULP3O75386 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP3O75386 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP3O75386 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP3O75386 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP3O75386 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TULP3O75386 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP3O75386 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP3O75386 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TULP3O75386 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TULP3O75386 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP3O75386 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP3O75386 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TULP3O75386 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TULP3O75386 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TULP3O75386 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP3O75386 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP3O75386 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP3O75386 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TULP3O75386 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP3O75386 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP3O75386 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP3O75386 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP3O75386 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TULP3O75386 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TULP3O75386 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TULP3O75386 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TULP3O75386 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.2 ms