Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ9O75208 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ9O75208 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COQ9O75208 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COQ9O75208 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COQ9O75208 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COQ9O75208 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ9O75208 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ9O75208 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ9O75208 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ9O75208 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COQ9O75208 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COQ9O75208 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COQ9O75208 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COQ9O75208 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms