Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC22O60826 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC22O60826 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC22O60826 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms