Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SRPX2O60687 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRPX2O60687 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRPX2O60687 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms