Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LRRTM2O43300 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
LRRTM2O43300 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRRTM2O43300 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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