Protein–RNA interactions for Protein: O15350

TP73, Tumor protein p73, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP73O15350 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TP73O15350 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TP73O15350 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TP73O15350 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TP73O15350 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TP73O15350 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TP73O15350 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP73O15350 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TP73O15350 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP73O15350 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP73O15350 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP73O15350 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TP73O15350 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TP73O15350 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TP73O15350 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP73O15350 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TP73O15350 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP73O15350 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TP73O15350 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP73O15350 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP73O15350 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TP73O15350 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TP73O15350 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TP73O15350 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP73O15350 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP73O15350 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP73O15350 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TP73O15350 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TP73O15350 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TP73O15350 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms