Protein–RNA interactions for Protein: O15212

PFDN6, Prefoldin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN6O15212 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PFDN6O15212 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFDN6O15212 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFDN6O15212 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms