Protein–RNA interactions for Protein: F8VUJ3

POC1B-GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POC1B-GALNT4F8VUJ3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POC1B-GALNT4F8VUJ3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms