Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMO7DNF2Z398 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMO7DNF2Z398 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LMO7DNF2Z398 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms