Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HMGB1P1B2RPK0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HMGB1P1B2RPK0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms