Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC160A6NGH7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC160A6NGH7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC160A6NGH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms