Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CFAP73A6NFT4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CFAP73A6NFT4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms