Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.26■■■□□ 2.44
ARFGEF2Q9Y6D5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARFGEF2Q9Y6D5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARFGEF2Q9Y6D5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ARFGEF2Q9Y6D5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms