Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ERG28Q9UKR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERG28Q9UKR5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERG28Q9UKR5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms